I säsongspremiären kämpar ett team med att vänja sig vid sina nya roller efter att Callen suspenderades och Hetty gått i pension.
Efter en drönarattack i Afghanistan påträffas en man död. Teamet måste kämpa till det yttersta för att utreda hans koppling till talibanerna.
Fyra personer dör i en explosion på en restaurang och NCIS-teamet kallas in för att ta reda på om fallet har kopplingar till ett visst sekretessbelagt projekt.
Nationens säkerhet står på spel när NCIS-teamet utreder en senatorkandidats död. Var det en olyckshändelse eller ett mord?
Efter att ha fått kryptisk post från en tidigare CIA-kollega blir Sam Hanna tagen till ett varuhus där han hittar ett lik, en vit pudel, såväl som pappersarbete, böcker och ett stort mysterium.
Utredningen fortsätter och det dyker upp bevis som binder den döda till en grupp ryska agenter. Sams mörkaste hemlighet riskerar samtidigt att avslöjas.
En kriminell handling läggs ut på internet och NCIS-teamet måste bege sig ned till stranden för att utreda vad en surfare och en död marinforskare kan ha med videon att göra.
En pensionerad CIA-agent blir mördad och teamet måste fråga ut Hetty om hennes förhållande till mannen.
NCIS-teamet utreder ett rån som kan ha kopplingar till terrorism. Kensi är tvungen att arbeta tillsammans med Granger medan Deeks vittnar i rätten.
Teamet har tagit semester, men Callen, Sam, Kensi och Deeks är vid havet för att lösa mordet på en död NCIS-agent. Samtidigt håller Eric och Nll fortet på kontoret.
Teamet kämpar för att lösa ett fall som involverar en rad bilstölder och det visar sig att en kvinna från Deeks förflutna är inblandad. Kensi går under täckmantel i en affär som säljer bildelar.
En marinsoldat dör och hans misstänksamma fru får hjälp att utreda fallet. Sam och Callen försöker att ta reda på om någon har fört dem bakom ljuset.
Teamet arbetar under täckmantel för att utreda ett kriminellt nätverk som misstänks ha kopplingar till terrorism.
Teamet måste gå under täckmantel för att bevaka ett brottssyndikat som misstänks för terrordåd.
Teamet tar reda på mer om den enda överlevande från en tidigare terrorgrupp. Kensi och Deeks följer spår som leder dem rakt ut i skogen.
Callen är orolig över Sam som är djupt involverad i en brottsutredning. Fallet rör en försvunnen släkting till den afghanske ledare som räddade Callen under ett uppdrag för många år sedan.
Sam fruktar för sin familjs säkerhet när hans fru återupptar en brottsutredning. Fallet involverar den ökände Sidorov och hans stulna kärnvapen.
Ett mordvapen i Idaho har troligen används vid ett angrepp i Los Angeles. Callen och Sam reser till Idaho för att gå med i NCIS: Red, en grupp som reser runt och löser brott.
NCIS-teamet i Los Angeles fortsätter att arbeta ihop med arbetsgruppen NCIS: Red. De måste kämpa mot klockan för att hitta terroristen innan han försvinner.
En marinlöjtnant och en pilot förgiftas med cyanid och NCIS-teamet måste avgöra om giftet var riktat mot dem, eller om det var ett test inför en mer omfattande attack.
Kensi och Deeks åker till Mexiko för att utreda ett fall som involverar en kartellboss försvunna lik. Resten av NCIS-teamet letar efter en potentiell läcka i DEA:s specialstyrka.
NCIS-teamet kämpar för att hitta en kvinna som har försvunnit spårlöst. Snart framkommer att hon är en hemlig agent från Hettys förflutna.
Deeks söker upplysningar om en ökänd vapenhandlare och går under täckmantel för att bli vän med en kvinnlig källa. Kensi övervakar Deeks och kvinnan men drabbas av oväntade känslor.
Jakten på stulna kärnvapen återupptas och Hetty skickar Callen och Kensi utomlands. Samtidigt hjälper Deeks till i USA, medan Sam och Michelle jobbar under täckmantel.