När de undersöker ett inbrott upptäcker ninjorna Prime Empire, ett sällsynt videospel som plötsligt tar kontroll över alla andra spel i Ninjago.
När ninjorna kopplar Jays försvinnande till Prime Empire, reser de till Dyers ö där de söker svar från spelets designer, Milton Dyer.
Cyrus Borg avslöjar en hemlighet om Prime Empire, medan ninjorna kämpar mot Mekanikern i deras försök att nå trettonde nivån i spelet.
Inuti Prime Empire är ninjorna i ett okänt område, kan inte reglerna, och de försöker att hitta Jay och undvika Unagamis Röda Visirer.
Inuti en av spelzonerna har en samuraj vid namn Okino en personlig kris när han misslyckas att leda sina Mästare till seger.
För att stoppa Unagami måste ninjorna vinna tre Keytanas, den första är gömd i Terra Karana - en av de allra farligaste spelzonerna.
Ninjorna bestiger Hysteriklippan och upptäcker att Unagami förvandlar spelare till energikuber så han kan bygga en portal till den riktiga världen.
Fast i spelzonen Terra Karana måste Okino välja om han vill hjälpa sina vänner ninjorna, eller lyda hans skapare Unagamis elaka order.
Ninjorna får veta att enda sättet att vinna den andra Keytanan på är att vinna ett lopp i Terra Technica, så de måste hitta tävlingsbilar.
Medan ninjorna förbereder sig inför Speedway Fem Miljard-loppet, träffar Lloyd en flicka som heter Förare Sju som kanske kan leda dem till segern.
Unagamis soldater, de Röda Visirerna, lyckas hitta Scotts hemliga verkstad och anfaller ninjorna.
Våra ninjor hinner knappt sörja förlusten av deras vän innan de brutalt kastas in i Terra Dominas vansinne.
I Ninjago City drar Zane och Pixal ut på gatorna för att hitta Milton Dyer, men de upptäcker att allt inte är som det ser ut.
Zane, som kidnappats av Mekanikern, möter Unagami i slutspelet, men Unagami ställs själv inför en ännu större utmaning.
Jay måste möta Unagami ensam i spelets slutrunda. Unagami ställs inför sanningen om hans egen identitet.
Unagami terroriserar Ninjago City. Jay, Zane och Pixal försöker att förhindra katastrofen genom att återförena Unagami och Dyer.
Ninjorna välkomnas till Shintaro av Kung Vangelis och prinsessan Vania. Cole blir kontaktad av en Geckel som heter Gleck som har på sig ett halsband som tillhörde Coles mamma. Prinsessan Vania leder Cole till en tunnel i berget och de avslöjar en underjordisk gruvdrift där Gecklar och Munser tvin...
Efter att ha kommit bort från de andra, förs Nya, Jay och Lloyd till Munsarnas "hemgrotta", av en Munsare som heter Murt. Där möter de Munsarnas drottning Murtessa, som blir förtjust i Jay, som hon anser vara en mäktig krigare. När hon upptäcker att Nya och Jay är ihop, utmanar hon Nya till en st...
Prinsessan Vania försöker att fånga Mäster Wu och Cole i fallet, men deras vikt sliter sönder hennes vingar. De tre vännerna faller djupare ned i berget. På vägen, utsätts de för bizarra hot och varelser innan de sveps över ett vattenfall och ner i en strömvirvel därde spolas upp på en strand i e...
Nya använder sina krafter för att tvinga Munce att sätta sig ned med Geckles på ett fredsmöte. Kai och Zane tvingas att använda sig utav trick för att manipulera Geckles att faktiskt dyka upp på fredsmötet.
Cole och dom Högsta anländer till Dödskallemagikerns fästning och hittar ninjorna inlåsta i burar. Samtidigt så har Geckles och Munce kedjats fast i ett kedjegäng och tvingas arbeta i gruvorna.
Samtidigt som Cole och Dödskallemagikern möter varandra så stormar Geckles och Munce fästningen, och Plundar befriar ninjorna från deras burar och ninjorna deltar i kampen mot Dödskallemagikern.