Efter ett uppdrag i Mexiko måste Callen, Sam och Kensi hitta ett sätt att ta sig hem tillsammans med den medvetslösa Deek. Mosely och den pensionerade amiralen Hollace Kilbride letar efter hjälp med att hitta deras saknade kollegor.
En prototyp av en attackdräkt stjäls från en Marinbas och används i ett smyckesrån. Teamet måste hitta vem som stal dräkten och lista ut vad nästa måll kan vara.
Callen och Sam anilitas att skydda Prince Kamal vars bulvan attackerats av en lönnmördare när han anlände till Los Angeles.
Medlemmar i NCIS är i fara efter att bilder och namn upptäckts på en kartells hitlista. Mosley frågas ut om det oregistrerade uppdraget i Mexico.
En informant som hjälper teamet med ett hemligt uppdrag, grips. Callen träffar ATF-agenten Anna Kolcheck som fortfarande är avstängd efter sitt förra uppdrag tillsammans med NCIS.
Teamet kallas in när Mosley blir inblandad i mordet på en lönnmördare, och de måste hitta henne innan hon går över gränsen.
Mordet på en vapenhandlare knyts till en rad olika brott, som ser ut att vara utförda av någon med elitträning, och teamet samarbetar med utrikesdepartementet.
Den biträdande chefen Ochoa skickar ut NCIS-teamet för att hjälpa till med en hemlig operation kopplad till en terroristgrupp som förespråkar extrem militärstyrka.
NCIS-teamet etterforsker ranet av marinekaptein Dean Hadlow, hvor ranerne fikk med seg penger, smykker og høyt klassifisert informasjon.
Teamet etterforsker et korrupt konsulentfirma, etter at det skjer et forseggjort bankran hvor en enkelt bankboks som tilhører selskapet ble stjålet.
Teamet leter etter en marine-reservist som lider av PTSD, og som forsvinner etter en beruset og kaotisk krangel.
Teamet etterforsker en mulig terrortrussel etter at logistikksjefen for en marinevåpenstasjon kollapser på jobben. Deeks og Kensi leter etter steder hvor de kan dra på bryllupsreise.
Teamet jobber med den globale straffedomstolen etter et brutalt angrepet på en syrisk person. Personen skulle levere bevis som viser at kjemiske våpen ble brukt på sivile.
Teamet samarbeider med FBI for å finne en terroristcelle i Los Angeles, som antas å forberede seg for et nært forestående angrep.
Innenfor den amerikanske marinens etterforskningsorgan, NCIS, finnes det en spesialavdeling hvor man pågriper farlige forbrytere som utgjør en trussel for landets sikkerhet.
Innenfor den amerikanske marinens etterforskningsorgan, NCIS, finnes det en spesialavdeling hvor man pågriper farlige forbrytere som utgjør en trussel for landets sikkerhet.